Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Trim12aQ99PQ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Trim12aQ99PQ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Trim12aQ99PQ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim12aQ99PQ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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