Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim26Q99PN3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms