Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc26a5Q99NH7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slc26a5Q99NH7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms