Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep41Q99NF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms