Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tdrd1Q99MV1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tdrd1Q99MV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms