Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nme5Q99MH5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms