Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gins4Q99LZ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gins4Q99LZ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms