Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL5

Pwp1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pwp1Q99LL5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pwp1Q99LL5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms