Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RtcbQ99LF4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RtcbQ99LF4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms