Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Clint1Q99KN9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clint1Q99KN9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clint1Q99KN9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Clint1Q99KN9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clint1Q99KN9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clint1Q99KN9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clint1Q99KN9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clint1Q99KN9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clint1Q99KN9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clint1Q99KN9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Clint1Q99KN9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Clint1Q99KN9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clint1Q99KN9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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