Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Reep3Q99KK1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Reep3Q99KK1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms