Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emc3Q99KI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emc3Q99KI3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms