Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hps4Q99KG7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps4Q99KG7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms