Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Me2Q99KE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Me2Q99KE1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms