Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krcc1Q99JT5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krcc1Q99JT5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms