Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ddb2Q99J79 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ddb2Q99J79 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ddb2Q99J79 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ddb2Q99J79 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddb2Q99J79 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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