Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Def8Q99J78 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Def8Q99J78 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms