Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thumpd1Q99J36 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd1Q99J36 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms