Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim11aQ99J19 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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