Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sf3b5Q923D4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b5Q923D4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms