Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrif1Q923B3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrif1Q923B3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms