Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Clip1Q922J3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clip1Q922J3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms