Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms