Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx18Q91ZR2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms