Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde6cQ91ZQ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde6cQ91ZQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms