Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cts3Q91ZD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms