Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc1Q91Z38 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc1Q91Z38 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms