Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rrp1bQ91YK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp1bQ91YK2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms