Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Basp1Q91XV3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Basp1Q91XV3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms