Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klc3Q91W40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms