Protein–RNA interactions for Protein: Q91VY6

Cytip, Cytohesin-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CytipQ91VY6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CytipQ91VY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CytipQ91VY6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms