Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nsmce2Q91VT1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms