Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NifkQ91VE6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NifkQ91VE6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms