Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk4Q8VEJ3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dkk4Q8VEJ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms