Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc92Q8VDN4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms