Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5C8

Zmynd11, Zinc finger MYND domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmynd11Q8R5C8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Zmynd11Q8R5C8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zmynd11Q8R5C8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms