Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms