Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1T1

Chmp7, Charged multivesicular body protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp7Q8R1T1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp7Q8R1T1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp7Q8R1T1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms