Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ebf4Q8K4J2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ebf4Q8K4J2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms