Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms