Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MyripQ8K3I4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MyripQ8K3I4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MyripQ8K3I4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms