Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prpf39Q8K2Z2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms