Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brd3Q8K2F0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brd3Q8K2F0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms