Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fcho1Q8K285 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fcho1Q8K285 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms