Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf3Q8K268 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf3Q8K268 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms