Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nek9Q8K1R7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nek9Q8K1R7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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