Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sde2Q8K1J5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sde2Q8K1J5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms