Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmbrd1Q8K0B2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms