Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LgsnQ8CIX8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LgsnQ8CIX8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms