Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip3Q8CHD8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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